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基因組學(xué)還有更多要揭示的東西
[ 發(fā)布日期:2024-7-11 8:39:22    閱讀次數(shù):540 ]
一篇新的社論發(fā)表在Oncotarget的第15卷上,題為“基因組學(xué)有更多的啟示”。來自里爾大學(xué)的研究人員 Laurène Fenwarth和Nicolas Duployez在這篇新的評論中討論了分子和細胞遺傳學(xué)分析應(yīng)用于識別突變和結(jié)構(gòu)變異,定義急性髓性白血病(AML)和骨髓增生異常綜合征(MDS)的不同亞型的進展。這些遺傳因素已成為風(fēng)險分層和選擇適當(dāng)治療(包括異體造血干細胞移植的使用)的必要因素。

作者指出,盡管自從急性髓性白血病(AML)基因組首次發(fā)表以來已經(jīng)進行了超過15年的基因組研究、以及癌癥基因組圖譜(TCGA)等大型研究,但根據(jù)目前的知識,仍有大約15%的急性髓性白血病(AML)病例在遺傳上無法分類。

值得注意的是,幾項針對成人和兒童的研究發(fā)現(xiàn),(AML)的一個亞群沒有已知的起始事件,但特別富集FLT3-ITD和WT1突變,以及總體預(yù)后不良的正常核型。在2021-2022年,特別是由于生物信息學(xué)方法和工具的進步,在高危兒童AML病例中發(fā)現(xiàn)了部分UBTF基因的復(fù)發(fā)性體細胞串聯(lián)重復(fù)(TD)。隨著回顧性隊列篩查的增加,與這種分子改變相關(guān)的特征已經(jīng)得到證實。UBTF-TD被認(rèn)為是白血病發(fā)生的起始事件,并定義了髓系惡性腫瘤的一個獨特群體。

據(jù)估計,UBTF-TD影響4%的兒科AML病例(9%的兒科AML復(fù)發(fā)病例),3%的年輕成人AML病例(18-60歲),60歲以后的病例不到0.5%。這些研究也證明了骨髓增生異常綜合征(MDS)的密切連續(xù)性。對無遺傳易感的兒童骨髓增生異常綜合征(MDS)病例的研究發(fā)現(xiàn),UBTF-TD突變的頻率約為30%。UBTF-TD與其他遺傳性病變的特定模式相關(guān),包括WT1突變(~ 50%),F(xiàn)LT3-ITD(~ 50%)和8染色體三體(~ 30%,而~ 60%的病例具有正常核型),并且與其他類別定義病變(即NPM1或cebpa - bzip突變和復(fù)發(fā)性融合)相互排斥。MDS/AML合并UBTF-TD的預(yù)后總體較差,通常為年輕患者群體。大多數(shù)可用的數(shù)據(jù)來自于AML病例,與UBTF野生型患者相比,接受強化化療±異基因造血干細胞移植治療的AML病例顯示更高的誘導(dǎo)失敗率和復(fù)發(fā)率,并且在評估時,治療后的最小殘留病(MRD)率更高。這些以前在基因上無法分類的病例的認(rèn)識,為在常規(guī)實踐中發(fā)現(xiàn)它們和開發(fā)新的治療策略鋪平了道路。特別是,轉(zhuǎn)錄研究表明HOXA/HOXB簇基因和MEIS1的高表達,這一特征也在NPM1突變的AML中發(fā)現(xiàn),表明對menin抑制劑敏感。最近的一項研究證實了UBTF-TD在原發(fā)性AML細胞中的這種敏感性,考慮到這種改變與FLT3-ITD的強烈關(guān)聯(lián),與FLT3抑制劑的聯(lián)合治療還需要進一步評估。


(文章來源:www.ebiotrade.com/newsf/2024-7/20240703050045669.htm

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