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MRD在肺癌術(shù)后監(jiān)測中的應(yīng)用
[ 發(fā)布日期:2024-5-29 17:17:17    閱讀次數(shù):523 ]
 
 

MRD與ctDNA

 

 

MRD (Minimal residual disease,微小殘留病灶)被定義為癌癥治療后留在體內(nèi)的少量癌細胞,(對治療沒有反應(yīng)或?qū)λ幬锂a(chǎn)生耐藥性),但可能最終導(dǎo)致疾病的復(fù)發(fā)。ctDNA檢測因可以確認術(shù)后MRD的存在而使實體瘤患者受益。另一方面,MRD檢測可以監(jiān)測和評估輔助化療和藥物耐藥性的生物標志物。



實體瘤MRD檢測技術(shù)路線

 

 

實體瘤MRD檢測主要有兩種策略:一種是基于腫瘤組織變異的腫瘤知情分析(tumor-informed),一種是不依賴腫瘤組織信息的腫瘤不知情分析(tumor-agnostic)。


Tumor-informed:通過基于腫瘤組織進行NGS測序,針對個體腫瘤特有的變異進行定制化的設(shè)計和分析,從而合成定制化Panel,然后對患者的血液樣本進行個性化 追蹤,從而檢測和定量ctDNA。


Tumor-agnostic:不需腫瘤組織信息,直接對患者的血液樣本進行NGS檢測,利用預(yù)先設(shè)定的癌基因突變Panel或者機器學(xué)習(xí)算法篩選預(yù)設(shè)腫瘤高頻變異位點,針對主要癌種或特定癌種進行分析。



肺癌與MRD

 

 

在非轉(zhuǎn)移性肺癌患者中,一些患者可以通過手術(shù)切除、放療和包括化療在內(nèi)的綜合治療。事實上,通過影像學(xué)檢查發(fā)現(xiàn)的復(fù)發(fā)或病變進展時,患者全身腫瘤負荷明顯增加。因此,對于根治性切除非小細胞肺癌的患者,在腫瘤負荷增加之前,MRD檢測是否可以識別復(fù)發(fā)的危險以及提供個性化的輔助治療引起廣泛的關(guān)注。

 

TRACERx研究顯示MRD可以預(yù)測常規(guī)影像學(xué)檢查前的復(fù)發(fā),且超過99%以上MRD陰性患者治療后無復(fù)發(fā)。

 

Gale等人報告,采用腫瘤特異性變異的48個擴增子,使用腫瘤特異性分析方法對每位患者進行術(shù)后MRD監(jiān)測。48例患者術(shù)后1-3天采集樣本,12份樣本(25%)檢測到ctDNA, eVAF中位數(shù)為0.0026%。因此,在完全切除的情況下,ctDNA可能以低濃度短暫存在于血液中。伴有原發(fā)性腫瘤的臨床復(fù)發(fā)患者中,18/28(64.3%)檢測到ctDNA。ctDNA檢測的臨床特異性>98.5%,并先于患者中臨床復(fù)發(fā)的中位數(shù)為212.5天。



MRD檢測自動化方案

 

 

最近幾年,越來越多的研究數(shù)據(jù)支持MRD在各實體瘤的復(fù)發(fā)監(jiān)測的作用。為了快速推動MRD的臨床應(yīng)用,奧美泰克提供MRD檢測的NGS文庫制備自動化方案,采用iLab-200 全自動基因測序文庫制備儀,可自動化實現(xiàn)1-96個樣本ctDNA的建庫、探針雜交捕獲、雜交后洗脫、PCR擴增、文庫pooling等流程。



參考文獻

1.Abbosh, C., Birkbak, N. J., Wilson, G. A., Jamal-Hanjani, M., Constantin, T., Salari, R.,et al. (2017). Phylogenetic ctDNA analysis depicts early-stage lung cancer evolution.Nature 545 (7655), 446–451. doi:10.1038/nature22364

2.Gale, D., Heider, K., Ruiz-Valdepenas, A., Hackinger, S., Perry, M., Marsico, G., et al.(2022). Residual ctDNA after treatment predicts early relapse in patients with earlystage non-small cell lung cancer. Ann. Oncol. 33 (5), 500–510. doi:10.1016/j.annonc.2022.02.007

3.Lemei Zhu,Ran Xu, Leilei Yang, Pingping Bing et al. Minimal residual disease (MRD)

 

detection in solid tumors using circulating tumor DNA: a systematic review. Front Genet. 2023; 14: 1172108. doi: 10.3389/fgene.2023.1172108



(文章來源:mp.weixin.qq.com/s/7tZRJ6QYLmPsGDM4AmL7iA

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