疾病的遺傳學研究，繪制驅(qū)動疾病的基因組片段。但要了解這些變化是如何導致疾病進展的，重要的是要了解它們?nèi)绾胃淖儽徽J為是驅(qū)動疾病的細胞群中疾病基因的基因調(diào)節(jié)。“增強基因圖譜”將基因組調(diào)控區(qū)域與基因聯(lián)系起來，對了解疾病至關(guān)重要。但是，由于目前實驗方法的局限性，構(gòu)建它們面臨著挑戰(zhàn)，這使得該技術(shù)難以應用于罕見的細胞群和只調(diào)節(jié)特定細胞類型的基因。
布里格姆婦女醫(yī)院(Brigham and Women 's Hospital)是麻省總醫(yī)院布里格姆醫(yī)療保健系統(tǒng)的創(chuàng)始成員之一，該醫(yī)院的研究人員開發(fā)了一種名為SCENT(單細胞增強子靶基因定位)的統(tǒng)計方法。這種方法使用多模態(tài)單細胞數(shù)據(jù)來建立調(diào)控元件和基因之間的聯(lián)系，使他們能夠查明常見和罕見疾病的可能致病基因位點。這些見解可能有助于開發(fā)各種疾病的治療方法。
研究小組將SCENT應用于代表各種人體組織的9個多模態(tài)單細胞數(shù)據(jù)集，包括免疫細胞、神經(jīng)元細胞和垂體細胞，旨在了解每種特定細胞類型中DNA調(diào)控的復雜性。利用這些數(shù)據(jù)，他們開發(fā)了23個不同的基因增強子圖譜，以研究與1143種疾病和特征相關(guān)的基因變異和表達模式。值得注意的是，他們發(fā)現(xiàn)，對于免疫疾病，關(guān)鍵的見解不僅來自免疫細胞，而且來自受影響組織本身的細胞。
“對于大多數(shù)自身免疫性疾病，人們認為我們需要一個免疫細胞的總體圖。但是我們發(fā)現(xiàn)免疫細胞的增強基因圖譜在受影響的疾病組織中是不同的，”布里格姆風濕病學、免疫學和炎癥學部門的Soumya Raychaudhuri醫(yī)學博士說。“我們展示了這種圖譜如何用于解釋類風濕性關(guān)節(jié)炎和其他自身免疫性疾病的遺傳數(shù)據(jù)。”
（文章來源：www.ebiotrade.com/newsf/2024-4）
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