由科羅拉多大學醫(yī)學院教師張帆（Fan Zhang）博士和Anna Helena Jonsson博士領導的新研究可能會帶來類風濕關節(jié)炎(RA)的新靶向治療，類風濕關節(jié)炎是一種導致關節(jié)炎癥和破壞的自身免疫性疾病。
他們的研究結果發(fā)表在《自然》雜志上，反映了作為加速藥物伙伴關系（Accelerating Medicines Partnership）成員的數(shù)十位研究人員共同努力的成果： 類風濕關節(jié)炎和系統(tǒng)性紅斑狼瘡(AMP: RA/SLE)網(wǎng)絡的成員。
AMP: RA/SLE網(wǎng)絡收集了來自英國等處的70名紅斑狼瘡患者的炎癥組織。Jonsson領導了一組科學家對這些樣本進行分析，而Zhang則領導了數(shù)據(jù)的計算分析。這些努力產生了一個包含超過30萬個滑膜組織細胞的細胞圖譜。進一步的分析顯示，根據(jù)它們的細胞組成，類風濕關節(jié)炎有六個不同的亞群。
Jonsson說：“我們希望這些數(shù)據(jù)能幫助我們發(fā)現(xiàn)新的治療目標，我們想把它公之于眾，這樣全國和世界各地的研究人員就可以繼續(xù)研究治療類風濕性關節(jié)炎的新思路。”
不用“guess-and-check ”
Jonsson既是一名執(zhí)業(yè)風濕病學家，也是一名研究人員，他知道風濕性關節(jié)炎患者對不同治療的反應不同。她說，到目前為止，風濕病學家使用“guess-and-check ”的方法來尋找對個體患者有效的治療方法。
利用Zhang和計算分析團隊開發(fā)的新數(shù)據(jù)和強大的計算分類方法，研究人員能夠將RA類型定量地分類為他們所謂的“細胞型豐度表型”或CTAPs。開發(fā)的方法，加上新的細胞圖譜，可以開始確定哪些患者對哪些治療有反應。
“即使你用這些簡單的標記物——T細胞標記物、B細胞、巨噬細胞和其他髓樣細胞、成纖維細胞、內皮細胞——對類風濕關節(jié)炎炎癥進行分類，我們發(fā)現(xiàn)，每一種分類都與我們已經(jīng)發(fā)現(xiàn)的非常具體的致病細胞類型有關。之前的類風濕關節(jié)炎研究發(fā)現(xiàn)，被稱為外周輔助性T細胞的T細胞群與類風濕關節(jié)炎有關，被稱為產生抗體的B細胞和其他特定細胞類型也是如此。我們發(fā)現(xiàn)它們通常不是一起被發(fā)現(xiàn)的。”
“例如，外周輔助細胞與B細胞只存在于一類RA中，而致病性巨噬細胞群體往往存在于另一類RA中。正因為如此，我們可以開始詢問這些特定合作伙伴如何協(xié)同工作。”
跨學科研究和跨機構的努力是關鍵
Zhang說：“我認為這是跨學科和大數(shù)據(jù)驅動的研究。許多新的發(fā)現(xiàn)是通過我們新穎的計算方法和系統(tǒng)免疫學方法產生的，我們使用了最先進的單細胞多模態(tài)技術來開發(fā)這種可重復的分類模式。這是風濕病精準醫(yī)療的一大進步。借助強大的人工智能計算方法，我們能夠整合大型單細胞組學、成像和臨床數(shù)據(jù)，以廣義的方式對患者異質性進行分層。”
CTAP研究是2018年開始的多中心聯(lián)合努力的一部分。它由加速藥物伙伴關系類風濕關節(jié)炎和系統(tǒng)性紅斑狼瘡網(wǎng)絡資助，這是由美國國立衛(wèi)生研究院和美國國立衛(wèi)生研究院基金會協(xié)調的一項倡議。該項目依靠一個全國性的研究團隊網(wǎng)絡，通過對風濕性關節(jié)炎和系統(tǒng)性紅斑狼瘡的關注，共同努力加深對自身免疫性疾病的理解。
“對炎癥亞群的研究也可能用于研究其他自身免疫性疾病或對癌癥或感染的免疫反應。從那里，它可能會被用來增加對多種不同疾病的了解”。
Zhang補充說:“建立疾病驅動的計算人工智能方法將是在多種免疫介導的疾病中產生可測試的假設的下一步。”
研究的沃土
對于Jonsson和Zhang來說，發(fā)表在《自然》雜志上的文章是他們多年工作的成果，而他們的工作始于兩人在哈佛大學布里格姆婦女醫(yī)院（Brigham and Women's Hospital）（哈佛大學的教學醫(yī)院）工作的時候。當他們來到CU醫(yī)學院時，他們帶著這個項目，希望與CU安舒茨醫(yī)學院的教職員工建立新的合作關系。
Jonsson說:“吸引我們來這里成立研究小組的原因之一是，科羅拉多大學醫(yī)學院的人類轉化研究非常強大。”
同樣，“我覺得這將是我們繼續(xù)我們的計算-實驗轉化醫(yī)學生產模式的最肥沃的土壤，”Zhang說。
（文章來源：www.ebiotrade.com/newsf/2023-11） | 
